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中南大学计算机学院房森彪博士学术报告

来源: 点击: 时间:2022年02月24日 15:59


报告题目 影响不同物种间ACE2与新型冠状病毒结合亲和力的关键氨基酸研究

报告时间 202232 下午 15:00

报告地点 腾讯会议号:870-895-875

告 人  房森彪   博士

报告摘要

非典型性新型冠状病毒肺炎,已成为国际性公共卫生紧急事件,严重威胁着全球人类的健康和生命安全。新型冠状病毒不仅可以导致人类患病,甚至其他物种也能够作为病毒宿主,造成“动物-动物”和“动物-人”之间交叉感染,对人类健康和全球生态平衡存在致命威胁。

研究中,基于NCBI蛋白数据库,通过“全序列”、“关键多肽”序列比对的方法,挑选出与人源ACE2蛋白序列相似度>60%并与人类关系亲密的191个物种。通过同源建模方法得到191个物种的ACE2蛋白结构,并进一步获取冠状病毒2019-nCov-Spike和人源特异性靶标受体ACE2蛋白之间复合物结构。通过结构叠合,得到冠状病毒2019-nCov-Spike区域和不同物种ACE2蛋白间直接作用界面随后,利用分子动力学模拟方法,计算得到各复合物体系间作用能量和结合模式。能量对比分析发现44个物种具有比人源更高的结合能。通过对多物种“蛋白-蛋白”结合界面进行统计分析,发现所有物种ACE2蛋白上含有14个“关键”极性氨基酸位点,对于稳定ACE2/2019-nCov-Spike相互作用占据绝对贡献力量。其中,10个极性氨基酸位点较为稳定,保证了冠状病毒2019-nCov-Spike蛋白与不同物种间ACE2之间的基本结合能力。另外,ACE2蛋白上存在4个氨基酸位点(人源氨基酸编码位置:Asp30Lys31His34Glu35),可能扮演者“triggering触发器”的效应,氨基酸差异能够明显影响不同物种ACE2/2019-nCov-Spike间结合自由能,对于不同物种结合冠状病毒扮演着至关重要的决定作用。本研究对于研究不同物种间ACE2蛋白与病毒间结合机理和致病机制,以及物种间交叉感染、后续疫苗与药物研发、维持全球生态平衡均具有较强的理论指导意义。

 

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